Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms