Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zc2hc1bQ9D534 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms