Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf128Q9D304 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms