Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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