Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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