Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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