Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms