Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms