Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms