Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms