Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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