Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms