Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms