Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms