Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ciao1Q99KN2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms