Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp11Q99K46 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp11Q99K46 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp11Q99K46 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp11Q99K46 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp11Q99K46 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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