Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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