Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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