Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smc1bQ920F6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smc1bQ920F6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smc1bQ920F6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smc1bQ920F6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smc1bQ920F6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smc1bQ920F6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smc1bQ920F6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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