Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms