Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d2Q8VD57 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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