Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms