Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matr3Q8K310 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms