Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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