Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkn3Q8K045 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms