Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rab11fip3Q8CHD8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip3Q8CHD8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms