Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms