Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4aQ8C9S8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms