Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a6Q8C6K9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a6Q8C6K9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms