Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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