Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3cQ80U95 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3cQ80U95 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms