Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vma21Q78T54 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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