Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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