Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms