Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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