Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SvoplQ6PDF3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms