Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms