Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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