Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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