Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KdsrQ6GV12 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms