Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ino80dQ66JY2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ino80dQ66JY2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ino80dQ66JY2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms