Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irf4Q64287 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Irf4Q64287 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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