Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
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