Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ccne1Q61457 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ccne1Q61457 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccne1Q61457 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccne1Q61457 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccne1Q61457 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccne1Q61457 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccne1Q61457 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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