Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms