Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtprnQ60673 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprnQ60673 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms