Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms