Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Syne3Q4FZC9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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