Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms