Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6899Q3USS0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms